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对云算GPM DNA夹杂图谱阐发体系,你想领会的都在这里了!

2021-03-23

领会装备先容请点击此处

1、C/S架构甚么意义?

C/S别离是Client和Server的首字母,也便是表现客户端/办事器。表现咱们的整套体系是由客户端阐发电脑和数据库存储办事器构成。办事器担任对数据存储,客户端电脑实现数据的阐发计较功效和数据的检索办理功效。

 

2、包罗二所的试剂盒吗?

软件可根据须要撑持自行导入试剂盒,并且也撑持导入人群基因频次等信息。

试剂盒.png

 

3、软件阐发速率怎样样?

普通2人夹杂数据在5分钟以内能够或许或许或许阐发实现,3人夹杂普通十几分钟实现。详细阐发时辰会根据图谱的品质,庞杂水平和已知信息等有所差别。

 

4、数据库存储数据量有几多?

咱们办事器标配2T+512G固态硬盘,能够或许或许或许撑持最少100万份数据存储。若是客户有须要能够或许或许或许额定对容量停止扩大。

 

5、云端架构在那里?

咱们整套体系的硬件设置装备摆设是包罗客户端和办事器的,一切硬件城市装置在采办的客户处。一切的办理权限也都交由客户办理。

 

6、除增添了一个数据库办理,与别的软件有甚么区分?

云算GPM中内置的几率分型软件依然是基于生物建模和MCMC计较道理开辟的,这也是今朝全持续法几率分型软件接纳的通用的道理。

从体系设置装备摆设来说,云算GPM体系将数据存储端与数据阐发端停止了分手,能够或许或许或许实现多人同时阐发,数据同一办理功效。

多人阐发都是在本身的客户端实现,计较负载并不加载到办事器上,不会由于阐发人数增添,而增添办事器的承担,不会影响计较速率。

 

7、 手头有夹杂图谱,能够或许或许或许拆分看看吗?

咱们近期会推出云算GPM试用勾当,请存眷咱们官方信息和弘德商城。也接待客户与咱们接洽。

 

8、 这套体系甚么价位?能与天下DNA数据库接洽干系吗? 

1)云算GPM是咱们引进德国专业DNA夹杂图谱阐发软件停止的二次开辟,其上风在于接纳了C/S架构,一切数据同一存储在数据库中,很是便于数据的检索和办理。

也很是便利与别的体系停止对接,比方与尝试室的LIMS对接,咱们下一步开辟的方针便是将体系与DNA数据库对接,能够或许或许或许疾速入库比对。咱们今朝已与国际某个开

发LIMS体系的公司成立了协作干系,在未几的未来就会实现这一功效。

 

2)整套体系装备1个办事器和2个客户端,办事器中装置数据存储数据库,2个客户端别离装置有一套自力的阐发软件,可知足两人同时阐发。体系报价请与咱们本地发卖担任人接洽。

 

9、体系阐发的精确率怎样样?

云算GPM体系在正式推出之前咱们已做了大批的测试任务,并且咱们也给国际某公安单元阐发过一个实在案例,拆分的成果也在数据库中完善的比中怀疑人。

 

10、发卖是根据客户端数目发卖吗?

云算GPM体系标配2个客户端和1个办事器,若是客户有须要的话能够或许或许或许对客户端数目停止扩大。

 

11、不肯定进献者数目怎样拆分?

云算GPM体系内置的几率分型软件除能够或许或许或许手动输出夹杂人数外,也撑持软件主动计较夹杂人数。软件内置了根据最大等位基因数和最大似然估量法两种方式计较夹杂人数,客户可根据须要挑选计较方式,普通3人以上的夹杂人数计较最大似然估量法更精确。

 

12、是不是颠末SWGDAM考证?

云算GPM内置的几率分型软件在开辟实现后已根据SWGDAM几率分型软件考证指南和ISFG DNA委员会对法医遗传先生物统计学软件的考证倡议停止了充实的考证。软件已根据规范请求对其活络度、特同性和生物模子履行精度停止了考证。并且软件已在欧洲列国普遍利用,已有上百万个实在案件阐发的经历。

 

13、最多能够或许或许或许做几小我的拆分?

撑持2-5人夹杂样本的拆分。

 

14、阐发实现果是甚么情势?图谱仍是CODIS?

数据阐发完后能够或许或许或许以PDF或WORD的格局导出报告。报告中包罗了每一个进献者,每一个位点的能够或许或许基因型和权重信息,也包罗似然比等统计学计较成果。报告闪现内容客户也能够或许或许或许根据须要自行调剂。

 

15、今朝国际利用环境,是不是获得法庭利用?

云算GPM内置的几率分型软件已在欧洲列国普遍利用,包罗医学研讨所,公立或私立尝试室,差人局等,该软件每一年城市阐发上万个案件样本。

根据SWGDAM法医DNA尝试室常染色体STR分型诠释指南请求在夹杂图谱给出包罗论断时都须要给出响应的统计学诠释。

该软件根据SWGDAM指南请求停止了考证,并且合适SWGDAM诠释指南请求,也合适德国DNA委员会对夹杂斑诠释倡议(The German Stain Commission: recommendations for the interpretation of mixed stains)请求,软件阐发成果能够或许或许或许作为法庭示证利用。

 

16、三人拆分的精确率有多高?

几率分型软件对夹杂图谱停止拆分后,会对每一个进献者的每一个位点基因型停止诠释,在报告中会给出每种能够或许或许基因型的权重信息。

客户除利用拆分出来的成果入库搜刮外,在有怀疑人图谱的环境下还能够或许或许或许停止似然比(LR)等统计学计较,便可赞助客户判定是不是下包罗论断,也可增添证据简直信度。

 

17、有不规范,拆分的能够或许或许或许拿来做证据?

今朝在外洋对夹杂图谱诠释是由规范或指南的,比方SWGDAM,FBI,German Stain Commission等都对DNA图谱诠释有倡议或指南,也都请求证据图谱在发生婚配或给出包罗论断的时辰要有统计学诠释,也能力作为法庭证据采取。

据咱们所知国际还不详细的规范文件能够或许或许或许参考,但国际专家正在普遍的调研取证,咱们也会主动的共同响应的任务,应当在未几的未来就会有响应的指南文件收回。

 

18、这个软件的拆分规范是甚么?

云算GPM内置的几率分型软件是基于全持续法的一种分型软件。其首要计较道理是经由进程成立一个生物模子来计较每一个等位基因的总产物量。

经由进程MCMC算法的迭代运算不时优化计较此中的各个参数,直到找到能够或许或许或许诠释证据图谱的最好基因型组合。全部计较进程比拟庞杂,触及良多统计学算法,这里没法睁开先容,请存眷瑞源官方宣布信息或与咱们接洽。

 

19、标配是多大设置装备摆设?

云算GPM规范设置装备摆设1个办事器和2个客户端,办事器中装置数据存储数据库,2个客户端别离装置有一套自力的阐发软件,可知足两人同时阐发。

 

20、对夹杂分型峰值有请求吗?

云算GPM是庞杂夹杂图谱阐发专家体系,不只能够或许或许或许阐发一般模板量发生的图谱,对低拷贝DNA发生的图谱也可阐发。因体系内置全持续法几率分型软件不只能够或许或许或许摹拟等位基因峰,Stutter峰等,也可摹拟drop-in/out,对低拷贝DNA,图谱中能够或许或许漏位点的环境也会给出公道的迷信的诠释。

 

21、这个和STRmix比拟拟,阿谁更合适国际用户?

STRmix是咱们前期推出的一款几率分型软件,其对夹杂图谱诠释成果已获得普遍承认,并且也在美国和新西兰市场普遍利用,在国际也有局部客户利用。

但在2019年末STRmix被新西兰当局列为对华禁售产物,咱们不得不停止该产物的国际发卖勾当,但已采办的客户的手艺办事咱们依然持续供给。

咱们看到在国际夹杂图谱的数目愈来愈多,并且夹杂图谱的阐发也是法医DNA尝试室的一个难点,为了鞭策国际夹杂图谱诠释与国际接轨,处理以后夹杂图谱阐发的难点,咱们以为持续在国际推行夹杂图谱阐发软件是非常成心义的。

以是在得悉STRmix对华禁售后就起头在市场上寻觅相干可替换产物。

云算GPM便是咱们引进德国MDG团体的全持续法几率分型软件Genoproof Mixture 3二次开辟而成的一整套体系。该体系包罗了原始数据阐发到夹杂数据拆分,统计学计较的全部流程。

云算GPM体系与STRmix区分在于STRmix属于单机版软件,而云算GPM实现了C/S架构,前期更利于二次开辟与别的体系对接。两个软件所接纳的生物模子和计较道理都是分歧的,首要功效方面,STRmix能实现的,云算GPM也能够或许或许或许实现。

 

22、利用前是不是须要大批样本停止尝试室外部参数考证?

不须要再做考证。云算GPM内置的几率分型软件在开辟实现后已根据SWGDAM几率分型软件考证指南和ISFG DNA委员会对法医遗传先生物统计学软件的考证倡议停止了充实的考证。软件已根据规范请求对其活络度、特同性和生物模子履行精度停止了考证。并且软件已在欧洲列国普遍利用,已有上百万个实在案件阐发的经历。